Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms