Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG3Q9NT62 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms