Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LTBP3Q9NS15 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
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