Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRE2

TSHZ2, Teashirt homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSHZ2Q9NRE2 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSHZ2Q9NRE2 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSHZ2Q9NRE2 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSHZ2Q9NRE2 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSHZ2Q9NRE2 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSHZ2Q9NRE2 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSHZ2Q9NRE2 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSHZ2Q9NRE2 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSHZ2Q9NRE2 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSHZ2Q9NRE2 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSHZ2Q9NRE2 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSHZ2Q9NRE2 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSHZ2Q9NRE2 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSHZ2Q9NRE2 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSHZ2Q9NRE2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSHZ2Q9NRE2 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSHZ2Q9NRE2 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSHZ2Q9NRE2 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSHZ2Q9NRE2 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSHZ2Q9NRE2 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSHZ2Q9NRE2 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSHZ2Q9NRE2 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSHZ2Q9NRE2 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSHZ2Q9NRE2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSHZ2Q9NRE2 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSHZ2Q9NRE2 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSHZ2Q9NRE2 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSHZ2Q9NRE2 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSHZ2Q9NRE2 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSHZ2Q9NRE2 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSHZ2Q9NRE2 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSHZ2Q9NRE2 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSHZ2Q9NRE2 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSHZ2Q9NRE2 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSHZ2Q9NRE2 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TSHZ2Q9NRE2 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSHZ2Q9NRE2 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TSHZ2Q9NRE2 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSHZ2Q9NRE2 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms