Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ76

MEPE, Matrix extracellular phosphoglycoprotein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEPEQ9NQ76 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MEPEQ9NQ76 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MEPEQ9NQ76 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms