Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms