Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD15

SRA1, Steroid receptor RNA activator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRA1Q9HD15 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRA1Q9HD15 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRA1Q9HD15 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRA1Q9HD15 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRA1Q9HD15 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRA1Q9HD15 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SRA1Q9HD15 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRA1Q9HD15 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRA1Q9HD15 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRA1Q9HD15 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SRA1Q9HD15 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRA1Q9HD15 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRA1Q9HD15 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRA1Q9HD15 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRA1Q9HD15 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRA1Q9HD15 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRA1Q9HD15 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRA1Q9HD15 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRA1Q9HD15 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRA1Q9HD15 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRA1Q9HD15 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRA1Q9HD15 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRA1Q9HD15 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRA1Q9HD15 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRA1Q9HD15 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRA1Q9HD15 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRA1Q9HD15 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRA1Q9HD15 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRA1Q9HD15 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRA1Q9HD15 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRA1Q9HD15 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRA1Q9HD15 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SRA1Q9HD15 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRA1Q9HD15 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRA1Q9HD15 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRA1Q9HD15 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SRA1Q9HD15 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRA1Q9HD15 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRA1Q9HD15 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRA1Q9HD15 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRA1Q9HD15 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRA1Q9HD15 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRA1Q9HD15 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRA1Q9HD15 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRA1Q9HD15 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SRA1Q9HD15 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRA1Q9HD15 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRA1Q9HD15 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRA1Q9HD15 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRA1Q9HD15 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRA1Q9HD15 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRA1Q9HD15 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRA1Q9HD15 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRA1Q9HD15 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms