Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms