Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BCAS3Q9H6U6 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BCAS3Q9H6U6 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BCAS3Q9H6U6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BCAS3Q9H6U6 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BCAS3Q9H6U6 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BCAS3Q9H6U6 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BCAS3Q9H6U6 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BCAS3Q9H6U6 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BCAS3Q9H6U6 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BCAS3Q9H6U6 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BCAS3Q9H6U6 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BCAS3Q9H6U6 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BCAS3Q9H6U6 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BCAS3Q9H6U6 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
BCAS3Q9H6U6 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms