Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLSTN2Q9H4D0 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLSTN2Q9H4D0 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLSTN2Q9H4D0 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLSTN2Q9H4D0 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLSTN2Q9H4D0 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLSTN2Q9H4D0 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLSTN2Q9H4D0 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLSTN2Q9H4D0 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLSTN2Q9H4D0 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLSTN2Q9H4D0 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CLSTN2Q9H4D0 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLSTN2Q9H4D0 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLSTN2Q9H4D0 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLSTN2Q9H4D0 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLSTN2Q9H4D0 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CLSTN2Q9H4D0 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLSTN2Q9H4D0 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLSTN2Q9H4D0 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLSTN2Q9H4D0 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLSTN2Q9H4D0 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLSTN2Q9H4D0 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLSTN2Q9H4D0 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLSTN2Q9H4D0 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLSTN2Q9H4D0 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLSTN2Q9H4D0 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLSTN2Q9H4D0 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLSTN2Q9H4D0 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLSTN2Q9H4D0 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLSTN2Q9H4D0 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLSTN2Q9H4D0 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLSTN2Q9H4D0 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLSTN2Q9H4D0 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CLSTN2Q9H4D0 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLSTN2Q9H4D0 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLSTN2Q9H4D0 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLSTN2Q9H4D0 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLSTN2Q9H4D0 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLSTN2Q9H4D0 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLSTN2Q9H4D0 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CLSTN2Q9H4D0 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLSTN2Q9H4D0 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLSTN2Q9H4D0 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLSTN2Q9H4D0 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLSTN2Q9H4D0 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLSTN2Q9H4D0 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLSTN2Q9H4D0 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLSTN2Q9H4D0 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms