Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms