Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E8

LNPK, Protein lunapark, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNPKQ9C0E8 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms