Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D7

ZC3H12C, Probable ribonuclease ZC3H12C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12CQ9C0D7 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZC3H12CQ9C0D7 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZC3H12CQ9C0D7 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZC3H12CQ9C0D7 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZC3H12CQ9C0D7 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZC3H12CQ9C0D7 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZC3H12CQ9C0D7 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZC3H12CQ9C0D7 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ZC3H12CQ9C0D7 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ZC3H12CQ9C0D7 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZC3H12CQ9C0D7 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ZC3H12CQ9C0D7 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZC3H12CQ9C0D7 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ZC3H12CQ9C0D7 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZC3H12CQ9C0D7 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZC3H12CQ9C0D7 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZC3H12CQ9C0D7 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZC3H12CQ9C0D7 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZC3H12CQ9C0D7 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZC3H12CQ9C0D7 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZC3H12CQ9C0D7 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZC3H12CQ9C0D7 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZC3H12CQ9C0D7 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZC3H12CQ9C0D7 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZC3H12CQ9C0D7 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZC3H12CQ9C0D7 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZC3H12CQ9C0D7 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ZC3H12CQ9C0D7 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZC3H12CQ9C0D7 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZC3H12CQ9C0D7 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZC3H12CQ9C0D7 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZC3H12CQ9C0D7 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ZC3H12CQ9C0D7 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ZC3H12CQ9C0D7 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZC3H12CQ9C0D7 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZC3H12CQ9C0D7 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZC3H12CQ9C0D7 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZC3H12CQ9C0D7 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ZC3H12CQ9C0D7 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZC3H12CQ9C0D7 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZC3H12CQ9C0D7 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZC3H12CQ9C0D7 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZC3H12CQ9C0D7 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZC3H12CQ9C0D7 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZC3H12CQ9C0D7 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZC3H12CQ9C0D7 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZC3H12CQ9C0D7 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZC3H12CQ9C0D7 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZC3H12CQ9C0D7 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZC3H12CQ9C0D7 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZC3H12CQ9C0D7 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZC3H12CQ9C0D7 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZC3H12CQ9C0D7 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZC3H12CQ9C0D7 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZC3H12CQ9C0D7 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZC3H12CQ9C0D7 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZC3H12CQ9C0D7 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZC3H12CQ9C0D7 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ZC3H12CQ9C0D7 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZC3H12CQ9C0D7 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZC3H12CQ9C0D7 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZC3H12CQ9C0D7 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZC3H12CQ9C0D7 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZC3H12CQ9C0D7 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZC3H12CQ9C0D7 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZC3H12CQ9C0D7 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZC3H12CQ9C0D7 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms