Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms