Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX5

GATA5, Transcription factor GATA-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA5Q9BWX5 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GATA5Q9BWX5 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GATA5Q9BWX5 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GATA5Q9BWX5 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GATA5Q9BWX5 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GATA5Q9BWX5 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GATA5Q9BWX5 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GATA5Q9BWX5 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GATA5Q9BWX5 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GATA5Q9BWX5 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GATA5Q9BWX5 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GATA5Q9BWX5 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GATA5Q9BWX5 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GATA5Q9BWX5 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GATA5Q9BWX5 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GATA5Q9BWX5 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GATA5Q9BWX5 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GATA5Q9BWX5 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GATA5Q9BWX5 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GATA5Q9BWX5 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GATA5Q9BWX5 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GATA5Q9BWX5 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GATA5Q9BWX5 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GATA5Q9BWX5 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GATA5Q9BWX5 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GATA5Q9BWX5 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GATA5Q9BWX5 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GATA5Q9BWX5 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GATA5Q9BWX5 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GATA5Q9BWX5 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GATA5Q9BWX5 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GATA5Q9BWX5 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GATA5Q9BWX5 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GATA5Q9BWX5 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GATA5Q9BWX5 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GATA5Q9BWX5 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GATA5Q9BWX5 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GATA5Q9BWX5 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GATA5Q9BWX5 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GATA5Q9BWX5 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GATA5Q9BWX5 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GATA5Q9BWX5 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GATA5Q9BWX5 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GATA5Q9BWX5 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GATA5Q9BWX5 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GATA5Q9BWX5 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GATA5Q9BWX5 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GATA5Q9BWX5 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GATA5Q9BWX5 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GATA5Q9BWX5 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GATA5Q9BWX5 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GATA5Q9BWX5 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GATA5Q9BWX5 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GATA5Q9BWX5 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GATA5Q9BWX5 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GATA5Q9BWX5 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GATA5Q9BWX5 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GATA5Q9BWX5 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GATA5Q9BWX5 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GATA5Q9BWX5 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GATA5Q9BWX5 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GATA5Q9BWX5 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GATA5Q9BWX5 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GATA5Q9BWX5 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GATA5Q9BWX5 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GATA5Q9BWX5 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GATA5Q9BWX5 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
GATA5Q9BWX5 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GATA5Q9BWX5 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GATA5Q9BWX5 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GATA5Q9BWX5 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
GATA5Q9BWX5 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GATA5Q9BWX5 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GATA5Q9BWX5 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GATA5Q9BWX5 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
GATA5Q9BWX5 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GATA5Q9BWX5 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GATA5Q9BWX5 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GATA5Q9BWX5 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GATA5Q9BWX5 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GATA5Q9BWX5 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
GATA5Q9BWX5 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GATA5Q9BWX5 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GATA5Q9BWX5 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GATA5Q9BWX5 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GATA5Q9BWX5 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GATA5Q9BWX5 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GATA5Q9BWX5 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
GATA5Q9BWX5 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GATA5Q9BWX5 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GATA5Q9BWX5 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GATA5Q9BWX5 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GATA5Q9BWX5 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GATA5Q9BWX5 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GATA5Q9BWX5 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GATA5Q9BWX5 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GATA5Q9BWX5 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GATA5Q9BWX5 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GATA5Q9BWX5 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GATA5Q9BWX5 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms