Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HIGD2AQ9BW72 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms