Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2AFJQ9BTM1 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2AFJQ9BTM1 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2AFJQ9BTM1 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2AFJQ9BTM1 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2AFJQ9BTM1 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2AFJQ9BTM1 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2AFJQ9BTM1 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2AFJQ9BTM1 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2AFJQ9BTM1 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2AFJQ9BTM1 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
H2AFJQ9BTM1 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2AFJQ9BTM1 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2AFJQ9BTM1 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
H2AFJQ9BTM1 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2AFJQ9BTM1 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
H2AFJQ9BTM1 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2AFJQ9BTM1 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2AFJQ9BTM1 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2AFJQ9BTM1 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2AFJQ9BTM1 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2AFJQ9BTM1 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2AFJQ9BTM1 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
H2AFJQ9BTM1 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2AFJQ9BTM1 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2AFJQ9BTM1 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2AFJQ9BTM1 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2AFJQ9BTM1 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2AFJQ9BTM1 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2AFJQ9BTM1 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2AFJQ9BTM1 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2AFJQ9BTM1 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2AFJQ9BTM1 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2AFJQ9BTM1 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2AFJQ9BTM1 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2AFJQ9BTM1 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2AFJQ9BTM1 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2AFJQ9BTM1 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2AFJQ9BTM1 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
H2AFJQ9BTM1 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2AFJQ9BTM1 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2AFJQ9BTM1 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2AFJQ9BTM1 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2AFJQ9BTM1 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2AFJQ9BTM1 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2AFJQ9BTM1 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2AFJQ9BTM1 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2AFJQ9BTM1 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2AFJQ9BTM1 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2AFJQ9BTM1 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
H2AFJQ9BTM1 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2AFJQ9BTM1 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2AFJQ9BTM1 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2AFJQ9BTM1 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2AFJQ9BTM1 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2AFJQ9BTM1 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2AFJQ9BTM1 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2AFJQ9BTM1 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
H2AFJQ9BTM1 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2AFJQ9BTM1 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
H2AFJQ9BTM1 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
H2AFJQ9BTM1 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
H2AFJQ9BTM1 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
H2AFJQ9BTM1 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
H2AFJQ9BTM1 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
H2AFJQ9BTM1 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
H2AFJQ9BTM1 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2AFJQ9BTM1 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2AFJQ9BTM1 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2AFJQ9BTM1 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2AFJQ9BTM1 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
H2AFJQ9BTM1 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2AFJQ9BTM1 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
H2AFJQ9BTM1 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2AFJQ9BTM1 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2AFJQ9BTM1 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
H2AFJQ9BTM1 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2AFJQ9BTM1 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2AFJQ9BTM1 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2AFJQ9BTM1 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2AFJQ9BTM1 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2AFJQ9BTM1 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2AFJQ9BTM1 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2AFJQ9BTM1 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2AFJQ9BTM1 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2AFJQ9BTM1 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2AFJQ9BTM1 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2AFJQ9BTM1 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2AFJQ9BTM1 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2AFJQ9BTM1 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2AFJQ9BTM1 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2AFJQ9BTM1 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2AFJQ9BTM1 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2AFJQ9BTM1 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2AFJQ9BTM1 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2AFJQ9BTM1 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2AFJQ9BTM1 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2AFJQ9BTM1 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2AFJQ9BTM1 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2AFJQ9BTM1 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms