Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms