Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRQ6

CHCHD6, MICOS complex subunit MIC25, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD6Q9BRQ6 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHCHD6Q9BRQ6 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHCHD6Q9BRQ6 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHCHD6Q9BRQ6 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHCHD6Q9BRQ6 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHCHD6Q9BRQ6 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHCHD6Q9BRQ6 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CHCHD6Q9BRQ6 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHCHD6Q9BRQ6 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHCHD6Q9BRQ6 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHCHD6Q9BRQ6 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHCHD6Q9BRQ6 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHCHD6Q9BRQ6 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHCHD6Q9BRQ6 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHCHD6Q9BRQ6 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHCHD6Q9BRQ6 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHCHD6Q9BRQ6 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHCHD6Q9BRQ6 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHCHD6Q9BRQ6 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHCHD6Q9BRQ6 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHCHD6Q9BRQ6 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHCHD6Q9BRQ6 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHCHD6Q9BRQ6 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHCHD6Q9BRQ6 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHCHD6Q9BRQ6 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHCHD6Q9BRQ6 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHCHD6Q9BRQ6 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CHCHD6Q9BRQ6 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHCHD6Q9BRQ6 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHCHD6Q9BRQ6 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHCHD6Q9BRQ6 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHCHD6Q9BRQ6 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHCHD6Q9BRQ6 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHCHD6Q9BRQ6 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CHCHD6Q9BRQ6 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHCHD6Q9BRQ6 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHCHD6Q9BRQ6 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHCHD6Q9BRQ6 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHCHD6Q9BRQ6 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHCHD6Q9BRQ6 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHCHD6Q9BRQ6 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHCHD6Q9BRQ6 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHCHD6Q9BRQ6 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHCHD6Q9BRQ6 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHCHD6Q9BRQ6 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHCHD6Q9BRQ6 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHCHD6Q9BRQ6 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHCHD6Q9BRQ6 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHCHD6Q9BRQ6 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHCHD6Q9BRQ6 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHCHD6Q9BRQ6 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHCHD6Q9BRQ6 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHCHD6Q9BRQ6 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHCHD6Q9BRQ6 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHCHD6Q9BRQ6 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHCHD6Q9BRQ6 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHCHD6Q9BRQ6 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHCHD6Q9BRQ6 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHCHD6Q9BRQ6 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHCHD6Q9BRQ6 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHCHD6Q9BRQ6 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHCHD6Q9BRQ6 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHCHD6Q9BRQ6 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHCHD6Q9BRQ6 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHCHD6Q9BRQ6 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHCHD6Q9BRQ6 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHCHD6Q9BRQ6 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHCHD6Q9BRQ6 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHCHD6Q9BRQ6 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CHCHD6Q9BRQ6 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHCHD6Q9BRQ6 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHCHD6Q9BRQ6 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CHCHD6Q9BRQ6 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHCHD6Q9BRQ6 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHCHD6Q9BRQ6 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHCHD6Q9BRQ6 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHCHD6Q9BRQ6 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHCHD6Q9BRQ6 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHCHD6Q9BRQ6 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHCHD6Q9BRQ6 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHCHD6Q9BRQ6 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHCHD6Q9BRQ6 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHCHD6Q9BRQ6 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHCHD6Q9BRQ6 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHCHD6Q9BRQ6 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHCHD6Q9BRQ6 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CHCHD6Q9BRQ6 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHCHD6Q9BRQ6 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHCHD6Q9BRQ6 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHCHD6Q9BRQ6 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHCHD6Q9BRQ6 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHCHD6Q9BRQ6 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHCHD6Q9BRQ6 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHCHD6Q9BRQ6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHCHD6Q9BRQ6 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHCHD6Q9BRQ6 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHCHD6Q9BRQ6 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHCHD6Q9BRQ6 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHCHD6Q9BRQ6 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHCHD6Q9BRQ6 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms