Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ75

CMSS1, Protein CMSS1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMSS1Q9BQ75 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms