Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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