Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAPPC9Q96Q05 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms