Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf72Q96LT7 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf72Q96LT7 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms