Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ABCC12Q96J65 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCC12Q96J65 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms