Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MS4A3Q96HJ5 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MS4A3Q96HJ5 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MS4A3Q96HJ5 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MS4A3Q96HJ5 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MS4A3Q96HJ5 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MS4A3Q96HJ5 IL36B-201ENST00000259213 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MS4A3Q96HJ5 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MS4A3Q96HJ5 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MS4A3Q96HJ5 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
MS4A3Q96HJ5 C8orf22-202ENST00000399653 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MS4A3Q96HJ5 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
MS4A3Q96HJ5 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MS4A3Q96HJ5 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
MS4A3Q96HJ5 RFC3P1-201ENST00000454568 682 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
MS4A3Q96HJ5 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MS4A3Q96HJ5 OR4A18P-201ENST00000529103 1088 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
MS4A3Q96HJ5 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
MS4A3Q96HJ5 ZEB2P1-202ENST00000572816 902 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MS4A3Q96HJ5 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MS4A3Q96HJ5 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
MS4A3Q96HJ5 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MS4A3Q96HJ5 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MS4A3Q96HJ5 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MS4A3Q96HJ5 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MS4A3Q96HJ5 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MS4A3Q96HJ5 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MS4A3Q96HJ5 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MS4A3Q96HJ5 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MS4A3Q96HJ5 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MS4A3Q96HJ5 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MS4A3Q96HJ5 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MS4A3Q96HJ5 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MS4A3Q96HJ5 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MS4A3Q96HJ5 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MS4A3Q96HJ5 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MS4A3Q96HJ5 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MS4A3Q96HJ5 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MS4A3Q96HJ5 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MS4A3Q96HJ5 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MS4A3Q96HJ5 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MS4A3Q96HJ5 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MS4A3Q96HJ5 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MS4A3Q96HJ5 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MS4A3Q96HJ5 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MS4A3Q96HJ5 ZNF626-201ENST00000291750 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MS4A3Q96HJ5 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MS4A3Q96HJ5 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MS4A3Q96HJ5 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
MS4A3Q96HJ5 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MS4A3Q96HJ5 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MS4A3Q96HJ5 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MS4A3Q96HJ5 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MS4A3Q96HJ5 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MS4A3Q96HJ5 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MS4A3Q96HJ5 AC060234.3-201ENST00000430438 559 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MS4A3Q96HJ5 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
MS4A3Q96HJ5 CFLAR-212ENST00000440180 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MS4A3Q96HJ5 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
MS4A3Q96HJ5 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MS4A3Q96HJ5 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
MS4A3Q96HJ5 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MS4A3Q96HJ5 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MS4A3Q96HJ5 AL139021.1-201ENST00000556734 436 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MS4A3Q96HJ5 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MS4A3Q96HJ5 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MS4A3Q96HJ5 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MS4A3Q96HJ5 AC134980.1-214ENST00000638815 687 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MS4A3Q96HJ5 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MS4A3Q96HJ5 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MS4A3Q96HJ5 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MS4A3Q96HJ5 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MS4A3Q96HJ5 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MS4A3Q96HJ5 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MS4A3Q96HJ5 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MS4A3Q96HJ5 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MS4A3Q96HJ5 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MS4A3Q96HJ5 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MS4A3Q96HJ5 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MS4A3Q96HJ5 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MS4A3Q96HJ5 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MS4A3Q96HJ5 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MS4A3Q96HJ5 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms