Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES6

MFSD3, Major facilitator superfamily domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD3Q96ES6 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MFSD3Q96ES6 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MFSD3Q96ES6 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MFSD3Q96ES6 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MFSD3Q96ES6 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MFSD3Q96ES6 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MFSD3Q96ES6 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MFSD3Q96ES6 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MFSD3Q96ES6 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MFSD3Q96ES6 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MFSD3Q96ES6 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MFSD3Q96ES6 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MFSD3Q96ES6 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MFSD3Q96ES6 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MFSD3Q96ES6 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MFSD3Q96ES6 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MFSD3Q96ES6 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MFSD3Q96ES6 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MFSD3Q96ES6 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MFSD3Q96ES6 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MFSD3Q96ES6 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MFSD3Q96ES6 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MFSD3Q96ES6 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MFSD3Q96ES6 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MFSD3Q96ES6 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MFSD3Q96ES6 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MFSD3Q96ES6 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MFSD3Q96ES6 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MFSD3Q96ES6 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MFSD3Q96ES6 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MFSD3Q96ES6 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MFSD3Q96ES6 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MFSD3Q96ES6 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MFSD3Q96ES6 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MFSD3Q96ES6 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MFSD3Q96ES6 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MFSD3Q96ES6 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MFSD3Q96ES6 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MFSD3Q96ES6 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MFSD3Q96ES6 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MFSD3Q96ES6 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MFSD3Q96ES6 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MFSD3Q96ES6 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MFSD3Q96ES6 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MFSD3Q96ES6 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MFSD3Q96ES6 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MFSD3Q96ES6 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MFSD3Q96ES6 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MFSD3Q96ES6 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MFSD3Q96ES6 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MFSD3Q96ES6 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MFSD3Q96ES6 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MFSD3Q96ES6 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MFSD3Q96ES6 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MFSD3Q96ES6 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MFSD3Q96ES6 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MFSD3Q96ES6 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MFSD3Q96ES6 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MFSD3Q96ES6 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MFSD3Q96ES6 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MFSD3Q96ES6 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MFSD3Q96ES6 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MFSD3Q96ES6 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MFSD3Q96ES6 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MFSD3Q96ES6 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
MFSD3Q96ES6 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MFSD3Q96ES6 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MFSD3Q96ES6 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MFSD3Q96ES6 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MFSD3Q96ES6 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MFSD3Q96ES6 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MFSD3Q96ES6 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MFSD3Q96ES6 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MFSD3Q96ES6 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MFSD3Q96ES6 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MFSD3Q96ES6 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MFSD3Q96ES6 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MFSD3Q96ES6 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MFSD3Q96ES6 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MFSD3Q96ES6 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MFSD3Q96ES6 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MFSD3Q96ES6 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MFSD3Q96ES6 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MFSD3Q96ES6 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MFSD3Q96ES6 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MFSD3Q96ES6 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MFSD3Q96ES6 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MFSD3Q96ES6 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MFSD3Q96ES6 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MFSD3Q96ES6 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MFSD3Q96ES6 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MFSD3Q96ES6 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MFSD3Q96ES6 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MFSD3Q96ES6 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MFSD3Q96ES6 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MFSD3Q96ES6 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MFSD3Q96ES6 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms