Protein–RNA interactions for Protein: Q96D59

RNF183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF183Q96D59 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RNF183Q96D59 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms