Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NKD1Q969G9 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NKD1Q969G9 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NKD1Q969G9 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
NKD1Q969G9 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NKD1Q969G9 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NKD1Q969G9 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NKD1Q969G9 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NKD1Q969G9 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NKD1Q969G9 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NKD1Q969G9 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NKD1Q969G9 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NKD1Q969G9 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NKD1Q969G9 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NKD1Q969G9 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NKD1Q969G9 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NKD1Q969G9 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKD1Q969G9 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKD1Q969G9 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NKD1Q969G9 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKD1Q969G9 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKD1Q969G9 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKD1Q969G9 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKD1Q969G9 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKD1Q969G9 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKD1Q969G9 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKD1Q969G9 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKD1Q969G9 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKD1Q969G9 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKD1Q969G9 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKD1Q969G9 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKD1Q969G9 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKD1Q969G9 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKD1Q969G9 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NKD1Q969G9 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKD1Q969G9 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKD1Q969G9 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKD1Q969G9 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKD1Q969G9 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKD1Q969G9 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKD1Q969G9 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKD1Q969G9 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKD1Q969G9 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKD1Q969G9 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKD1Q969G9 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKD1Q969G9 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKD1Q969G9 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKD1Q969G9 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKD1Q969G9 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKD1Q969G9 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKD1Q969G9 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKD1Q969G9 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKD1Q969G9 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NKD1Q969G9 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKD1Q969G9 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKD1Q969G9 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKD1Q969G9 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKD1Q969G9 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKD1Q969G9 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKD1Q969G9 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKD1Q969G9 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKD1Q969G9 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKD1Q969G9 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKD1Q969G9 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKD1Q969G9 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NKD1Q969G9 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKD1Q969G9 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKD1Q969G9 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKD1Q969G9 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKD1Q969G9 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKD1Q969G9 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKD1Q969G9 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NKD1Q969G9 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKD1Q969G9 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKD1Q969G9 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKD1Q969G9 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKD1Q969G9 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKD1Q969G9 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKD1Q969G9 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NKD1Q969G9 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKD1Q969G9 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKD1Q969G9 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKD1Q969G9 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKD1Q969G9 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKD1Q969G9 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKD1Q969G9 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKD1Q969G9 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NKD1Q969G9 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKD1Q969G9 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKD1Q969G9 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKD1Q969G9 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKD1Q969G9 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKD1Q969G9 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKD1Q969G9 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKD1Q969G9 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKD1Q969G9 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKD1Q969G9 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKD1Q969G9 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKD1Q969G9 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKD1Q969G9 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms