Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GIPC3Q8TF64 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms