Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX29Q8TEQ0 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms