Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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ZNF548Q8NEK5 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF548Q8NEK5 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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