Protein–RNA interactions for Protein: Q8N456

LRRC18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC18Q8N456 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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LRRC18Q8N456 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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LRRC18Q8N456 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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LRRC18Q8N456 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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LRRC18Q8N456 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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LRRC18Q8N456 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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LRRC18Q8N456 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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LRRC18Q8N456 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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LRRC18Q8N456 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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LRRC18Q8N456 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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LRRC18Q8N456 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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LRRC18Q8N456 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC18Q8N456 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms