Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLF2Q8IX21 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLF2Q8IX21 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLF2Q8IX21 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLF2Q8IX21 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLF2Q8IX21 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLF2Q8IX21 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLF2Q8IX21 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLF2Q8IX21 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLF2Q8IX21 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLF2Q8IX21 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLF2Q8IX21 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLF2Q8IX21 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLF2Q8IX21 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLF2Q8IX21 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLF2Q8IX21 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLF2Q8IX21 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLF2Q8IX21 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLF2Q8IX21 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLF2Q8IX21 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SLF2Q8IX21 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SLF2Q8IX21 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLF2Q8IX21 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SLF2Q8IX21 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SLF2Q8IX21 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLF2Q8IX21 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLF2Q8IX21 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SLF2Q8IX21 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SLF2Q8IX21 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLF2Q8IX21 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SLF2Q8IX21 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLF2Q8IX21 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SLF2Q8IX21 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLF2Q8IX21 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLF2Q8IX21 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLF2Q8IX21 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLF2Q8IX21 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLF2Q8IX21 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLF2Q8IX21 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLF2Q8IX21 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLF2Q8IX21 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLF2Q8IX21 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLF2Q8IX21 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLF2Q8IX21 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SLF2Q8IX21 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLF2Q8IX21 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLF2Q8IX21 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLF2Q8IX21 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLF2Q8IX21 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLF2Q8IX21 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLF2Q8IX21 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLF2Q8IX21 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLF2Q8IX21 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLF2Q8IX21 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SLF2Q8IX21 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLF2Q8IX21 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLF2Q8IX21 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLF2Q8IX21 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLF2Q8IX21 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLF2Q8IX21 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLF2Q8IX21 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLF2Q8IX21 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLF2Q8IX21 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLF2Q8IX21 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLF2Q8IX21 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLF2Q8IX21 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLF2Q8IX21 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLF2Q8IX21 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLF2Q8IX21 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLF2Q8IX21 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLF2Q8IX21 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLF2Q8IX21 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLF2Q8IX21 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLF2Q8IX21 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SLF2Q8IX21 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLF2Q8IX21 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLF2Q8IX21 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
SLF2Q8IX21 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLF2Q8IX21 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLF2Q8IX21 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SLF2Q8IX21 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SLF2Q8IX21 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLF2Q8IX21 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLF2Q8IX21 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLF2Q8IX21 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLF2Q8IX21 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLF2Q8IX21 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLF2Q8IX21 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLF2Q8IX21 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLF2Q8IX21 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLF2Q8IX21 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLF2Q8IX21 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLF2Q8IX21 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLF2Q8IX21 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLF2Q8IX21 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SLF2Q8IX21 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLF2Q8IX21 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLF2Q8IX21 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLF2Q8IX21 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLF2Q8IX21 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms