Protein–RNA interactions for Protein: Q86V81

ALYREF, THO complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREFQ86V81 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALYREFQ86V81 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALYREFQ86V81 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ALYREFQ86V81 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALYREFQ86V81 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALYREFQ86V81 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALYREFQ86V81 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALYREFQ86V81 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALYREFQ86V81 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALYREFQ86V81 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALYREFQ86V81 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALYREFQ86V81 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ALYREFQ86V81 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ALYREFQ86V81 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ALYREFQ86V81 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ALYREFQ86V81 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ALYREFQ86V81 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ALYREFQ86V81 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALYREFQ86V81 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALYREFQ86V81 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALYREFQ86V81 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALYREFQ86V81 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALYREFQ86V81 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALYREFQ86V81 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALYREFQ86V81 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALYREFQ86V81 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALYREFQ86V81 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALYREFQ86V81 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALYREFQ86V81 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALYREFQ86V81 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALYREFQ86V81 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALYREFQ86V81 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALYREFQ86V81 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALYREFQ86V81 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALYREFQ86V81 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALYREFQ86V81 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALYREFQ86V81 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALYREFQ86V81 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALYREFQ86V81 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALYREFQ86V81 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALYREFQ86V81 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALYREFQ86V81 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALYREFQ86V81 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALYREFQ86V81 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALYREFQ86V81 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALYREFQ86V81 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALYREFQ86V81 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALYREFQ86V81 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALYREFQ86V81 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALYREFQ86V81 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALYREFQ86V81 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALYREFQ86V81 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALYREFQ86V81 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALYREFQ86V81 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALYREFQ86V81 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALYREFQ86V81 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALYREFQ86V81 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALYREFQ86V81 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ALYREFQ86V81 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALYREFQ86V81 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALYREFQ86V81 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALYREFQ86V81 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALYREFQ86V81 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALYREFQ86V81 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALYREFQ86V81 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALYREFQ86V81 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALYREFQ86V81 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALYREFQ86V81 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALYREFQ86V81 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALYREFQ86V81 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALYREFQ86V81 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALYREFQ86V81 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALYREFQ86V81 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALYREFQ86V81 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALYREFQ86V81 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ALYREFQ86V81 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALYREFQ86V81 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALYREFQ86V81 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALYREFQ86V81 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALYREFQ86V81 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALYREFQ86V81 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALYREFQ86V81 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALYREFQ86V81 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALYREFQ86V81 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALYREFQ86V81 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALYREFQ86V81 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALYREFQ86V81 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ALYREFQ86V81 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALYREFQ86V81 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ALYREFQ86V81 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ALYREFQ86V81 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALYREFQ86V81 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALYREFQ86V81 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ALYREFQ86V81 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALYREFQ86V81 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ALYREFQ86V81 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALYREFQ86V81 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALYREFQ86V81 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALYREFQ86V81 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALYREFQ86V81 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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