Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG4DQ86TL0 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms