Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYT9Q86SS6 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms