Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7G1

CLNK, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNKQ7Z7G1 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLNKQ7Z7G1 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLNKQ7Z7G1 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLNKQ7Z7G1 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLNKQ7Z7G1 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLNKQ7Z7G1 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLNKQ7Z7G1 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLNKQ7Z7G1 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLNKQ7Z7G1 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLNKQ7Z7G1 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLNKQ7Z7G1 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CLNKQ7Z7G1 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLNKQ7Z7G1 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CLNKQ7Z7G1 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLNKQ7Z7G1 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLNKQ7Z7G1 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLNKQ7Z7G1 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLNKQ7Z7G1 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLNKQ7Z7G1 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLNKQ7Z7G1 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLNKQ7Z7G1 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLNKQ7Z7G1 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLNKQ7Z7G1 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLNKQ7Z7G1 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLNKQ7Z7G1 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLNKQ7Z7G1 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CLNKQ7Z7G1 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLNKQ7Z7G1 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLNKQ7Z7G1 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLNKQ7Z7G1 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLNKQ7Z7G1 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLNKQ7Z7G1 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLNKQ7Z7G1 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLNKQ7Z7G1 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLNKQ7Z7G1 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CLNKQ7Z7G1 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLNKQ7Z7G1 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLNKQ7Z7G1 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLNKQ7Z7G1 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLNKQ7Z7G1 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CLNKQ7Z7G1 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLNKQ7Z7G1 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CLNKQ7Z7G1 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLNKQ7Z7G1 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLNKQ7Z7G1 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLNKQ7Z7G1 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLNKQ7Z7G1 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLNKQ7Z7G1 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLNKQ7Z7G1 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLNKQ7Z7G1 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLNKQ7Z7G1 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLNKQ7Z7G1 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLNKQ7Z7G1 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLNKQ7Z7G1 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLNKQ7Z7G1 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLNKQ7Z7G1 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLNKQ7Z7G1 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLNKQ7Z7G1 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLNKQ7Z7G1 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLNKQ7Z7G1 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLNKQ7Z7G1 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLNKQ7Z7G1 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLNKQ7Z7G1 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLNKQ7Z7G1 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLNKQ7Z7G1 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLNKQ7Z7G1 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLNKQ7Z7G1 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLNKQ7Z7G1 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLNKQ7Z7G1 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLNKQ7Z7G1 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLNKQ7Z7G1 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLNKQ7Z7G1 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLNKQ7Z7G1 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLNKQ7Z7G1 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLNKQ7Z7G1 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLNKQ7Z7G1 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLNKQ7Z7G1 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CLNKQ7Z7G1 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLNKQ7Z7G1 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLNKQ7Z7G1 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLNKQ7Z7G1 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLNKQ7Z7G1 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLNKQ7Z7G1 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLNKQ7Z7G1 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLNKQ7Z7G1 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLNKQ7Z7G1 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLNKQ7Z7G1 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLNKQ7Z7G1 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLNKQ7Z7G1 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLNKQ7Z7G1 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLNKQ7Z7G1 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLNKQ7Z7G1 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLNKQ7Z7G1 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CLNKQ7Z7G1 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLNKQ7Z7G1 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLNKQ7Z7G1 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLNKQ7Z7G1 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLNKQ7Z7G1 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLNKQ7Z7G1 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLNKQ7Z7G1 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms