Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
STRCQ7RTU9 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
STRCQ7RTU9 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
STRCQ7RTU9 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
STRCQ7RTU9 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
STRCQ7RTU9 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
STRCQ7RTU9 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
STRCQ7RTU9 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
STRCQ7RTU9 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
STRCQ7RTU9 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
STRCQ7RTU9 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
STRCQ7RTU9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
STRCQ7RTU9 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
STRCQ7RTU9 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
STRCQ7RTU9 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
STRCQ7RTU9 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
STRCQ7RTU9 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
STRCQ7RTU9 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
STRCQ7RTU9 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
STRCQ7RTU9 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
STRCQ7RTU9 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
STRCQ7RTU9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
STRCQ7RTU9 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
STRCQ7RTU9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
STRCQ7RTU9 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
STRCQ7RTU9 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
STRCQ7RTU9 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
STRCQ7RTU9 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
STRCQ7RTU9 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
STRCQ7RTU9 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
STRCQ7RTU9 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
STRCQ7RTU9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
STRCQ7RTU9 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
STRCQ7RTU9 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
STRCQ7RTU9 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
STRCQ7RTU9 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
STRCQ7RTU9 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
STRCQ7RTU9 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
STRCQ7RTU9 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
STRCQ7RTU9 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
STRCQ7RTU9 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
STRCQ7RTU9 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
STRCQ7RTU9 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
STRCQ7RTU9 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
STRCQ7RTU9 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
STRCQ7RTU9 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
STRCQ7RTU9 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
STRCQ7RTU9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
STRCQ7RTU9 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
STRCQ7RTU9 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
STRCQ7RTU9 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
STRCQ7RTU9 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
STRCQ7RTU9 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
STRCQ7RTU9 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
STRCQ7RTU9 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
STRCQ7RTU9 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
STRCQ7RTU9 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
STRCQ7RTU9 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC25■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC25■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC25■■□□□ 1.59
STRCQ7RTU9 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms