Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTF1AQ7RTS3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms