Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYDE1Q6ZW31 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms