Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms