Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms