Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q6P435 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Q6P435 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q6P435 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q6P435 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q6P435 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q6P435 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q6P435 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q6P435 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q6P435 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q6P435 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q6P435 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Q6P435 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Q6P435 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Q6P435 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Q6P435 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q6P435 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q6P435 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q6P435 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q6P435 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q6P435 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q6P435 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q6P435 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q6P435 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q6P435 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q6P435 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q6P435 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q6P435 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q6P435 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q6P435 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q6P435 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q6P435 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q6P435 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q6P435 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q6P435 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q6P435 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Q6P435 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Q6P435 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q6P435 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q6P435 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q6P435 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q6P435 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q6P435 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q6P435 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q6P435 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q6P435 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q6P435 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Q6P435 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q6P435 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q6P435 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Q6P435 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q6P435 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q6P435 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q6P435 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q6P435 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q6P435 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q6P435 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q6P435 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q6P435 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q6P435 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q6P435 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q6P435 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q6P435 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q6P435 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q6P435 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q6P435 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q6P435 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q6P435 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q6P435 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q6P435 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q6P435 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q6P435 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Q6P435 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q6P435 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q6P435 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q6P435 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q6P435 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q6P435 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q6P435 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q6P435 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Q6P435 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q6P435 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q6P435 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q6P435 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q6P435 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q6P435 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q6P435 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q6P435 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q6P435 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Q6P435 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q6P435 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Q6P435 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Q6P435 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q6P435 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Q6P435 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q6P435 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q6P435 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q6P435 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q6P435 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q6P435 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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