Protein–RNA interactions for Protein: Q68J44

DUPD1, Dual specificity phosphatase DUPD1, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUPD1Q68J44 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUPD1Q68J44 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUPD1Q68J44 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUPD1Q68J44 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUPD1Q68J44 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUPD1Q68J44 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUPD1Q68J44 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUPD1Q68J44 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUPD1Q68J44 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUPD1Q68J44 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUPD1Q68J44 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUPD1Q68J44 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUPD1Q68J44 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUPD1Q68J44 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUPD1Q68J44 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUPD1Q68J44 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUPD1Q68J44 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUPD1Q68J44 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUPD1Q68J44 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUPD1Q68J44 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUPD1Q68J44 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUPD1Q68J44 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUPD1Q68J44 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUPD1Q68J44 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUPD1Q68J44 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUPD1Q68J44 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUPD1Q68J44 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUPD1Q68J44 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DUPD1Q68J44 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUPD1Q68J44 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUPD1Q68J44 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUPD1Q68J44 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUPD1Q68J44 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUPD1Q68J44 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUPD1Q68J44 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUPD1Q68J44 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUPD1Q68J44 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUPD1Q68J44 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUPD1Q68J44 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUPD1Q68J44 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUPD1Q68J44 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUPD1Q68J44 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUPD1Q68J44 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUPD1Q68J44 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUPD1Q68J44 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUPD1Q68J44 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUPD1Q68J44 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUPD1Q68J44 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUPD1Q68J44 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
DUPD1Q68J44 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUPD1Q68J44 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUPD1Q68J44 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUPD1Q68J44 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUPD1Q68J44 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
DUPD1Q68J44 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
DUPD1Q68J44 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUPD1Q68J44 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUPD1Q68J44 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUPD1Q68J44 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUPD1Q68J44 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUPD1Q68J44 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUPD1Q68J44 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUPD1Q68J44 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUPD1Q68J44 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUPD1Q68J44 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUPD1Q68J44 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUPD1Q68J44 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUPD1Q68J44 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUPD1Q68J44 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUPD1Q68J44 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUPD1Q68J44 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
DUPD1Q68J44 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUPD1Q68J44 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUPD1Q68J44 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUPD1Q68J44 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUPD1Q68J44 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUPD1Q68J44 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUPD1Q68J44 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUPD1Q68J44 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUPD1Q68J44 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUPD1Q68J44 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
DUPD1Q68J44 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUPD1Q68J44 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUPD1Q68J44 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUPD1Q68J44 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUPD1Q68J44 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUPD1Q68J44 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUPD1Q68J44 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUPD1Q68J44 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUPD1Q68J44 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
DUPD1Q68J44 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUPD1Q68J44 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
DUPD1Q68J44 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
DUPD1Q68J44 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUPD1Q68J44 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUPD1Q68J44 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUPD1Q68J44 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUPD1Q68J44 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUPD1Q68J44 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUPD1Q68J44 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms