Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USPL1Q5W0Q7 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USPL1Q5W0Q7 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USPL1Q5W0Q7 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms