Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU9

C9orf84, Uncharacterized protein C9orf84, humanhuman

Predictions only

Length 1,444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf84Q5VXU9 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
C9orf84Q5VXU9 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
C9orf84Q5VXU9 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
C9orf84Q5VXU9 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
C9orf84Q5VXU9 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
C9orf84Q5VXU9 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
C9orf84Q5VXU9 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
C9orf84Q5VXU9 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms