Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUSD4Q5VX71 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms