Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RFTN2Q52LD8 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms