Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TPRNQ4KMQ1 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms