Protein–RNA interactions for Protein: Q49AH0

CDNF, Cerebral dopamine neurotrophic factor, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDNFQ49AH0 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDNFQ49AH0 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms